בתהליך ריפוי השום במי מלח, הקפדה על נקיון וחיטוי של המיכל היא צעד חשוב למנוע בעיות בטיחות מזון. להלן מספר שיטות ניקוי וחיטוי מומלצות:

שיטת חיטוי פיזית: ניתן לחטא את המיכל על ידי קיטור או רתיחה, בדרך כלל נשלט ב-100 מעלות ונשמר במשך יותר מ-10 דקות; או השתמשו בחיטוי אינפרא אדום, הטמפרטורה נשלטת מעל 120 מעלות צלזיוס, גם נשמרת במשך יותר מ-10 דקות. שיטות אלה יכולות להרוג ביעילות מיקרואורגניזמים על פני המיכל.

שיטת חיטוי כימי: השתמשו בחומרי חיטוי כימיים כמו חומרי חיטוי המכילים כלור לצורך חיטוי. יש להכין את חומר החיטוי בהתאם לדרישות הוראות המוצר. לדוגמה, השתמשו בחומר חיטוי המכיל כלור עם ריכוז כלור יעיל של יותר מ-250 מ"ג/ליטר, טבלו את המיכל בחומר החיטוי למשך יותר מ-5 דקות, ולאחר מכן שטפו אותו במים זורמים.

חיטוי אולטרה סגול: קרינה אולטרה סגולה של מיקרואורגניזמים עלולה לגרום לתגובות כימיות בתוך המולקולות שלהם ולגרום למוות, דבר המתאים לעיקור של מכלי מזון שונים.

חיטוי אוזון: האוזון הוא חומר מחמצן חזק וחומר חיטוי רב עוצמה, ניתן לשילוב במים תוך פרק זמן קצר, כוח קוטל החיידקים חזק מאוד, ניתן להשתמש בו לטיהור המים וחיטוי המיכל.

טכנולוגיית עיקור בקיטור מחומם-על: שימוש בתרסיס קיטור מחומם ב-130 מעלות -160 מעלות על המיכל, מספר שניות להשלמת פעולת העיקור, מתאים לעיקור מיכל אריזות מזון עמיד בחום.

חיטוי דינמי: בתהליך עיבוד המזון נעשה שימוש בציוד חיטוי לחיטוי החלל בו-זמנית, ולמעשה נמנע מזיהום משני של מזון על ידי חיידקים באוויר.

הכנה ושימוש בחומר חיטוי: בעת שימוש בחומרי חיטוי, יש להקפיד על ריכוז החומרים היעילים, ולהאריך את זמן החיטוי כראוי לאחר החיטוי כדי להבטיח שהמיכל יהיה מעוקר במלואו.

כדי להבטיח שהחיטוי הנקי של המיכל הוא החוליה המרכזית של בטיחות המזון, השיטה לעיל יכולה להתבסס על המצב בפועל ותנאי הציוד לבחירת שיטת החיטוי המתאימה, על מנת להבטיח את בריאותו ובטיחותו של מזון כבוש.